在真空冷凍干燥機的電氣控制系統中，zui重要的核心就是冷凍干燥機的控制和保護，例如真空冷凍干燥機的溫度控制、流量控制、壓力控制、真空冷凍干燥機的溫度保護、流量保護、壓力保護、過電流與過電壓保護等多個方面，在真空冷凍干燥機的部件控制中，zui重要的是進口壓縮機的保護與控制。上海拓紛生產的真空冷凍干燥機主要采用進口壓縮機，它zui基本的控制則是開關控制。開啟式和部分半封閉式制冷壓縮機都可以通過容積的調節和轉速的調節來控制壓縮機的容量，即制冷系統的制冷量，從而達到真空冷凍干燥機的溫度控制；全封閉壓縮機則只需調節轉速。壓縮機的控制方式是雙位調節，開停控制參數通常是制冷溫度和真空度。其特點是溫度控制精度較低，但控制簡單可靠。真空冷凍干燥機的電氣控制系統由結構來分類，控制和顯示器件有電子式和機械式兩大類。真空冷凍干燥機的電氣控制系統由工作原理來分類，控制和顯示器件則有數字式和模擬式兩大類。電子式凍干機控制器所用控制線路較復雜、所以凍干機的電氣控制系統成本總體較高，而機械式真空冷凍干燥機控制器所用控制線路簡單，電氣控制系統總體成本相對較低。